RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 C12orf42Q96LP6 360 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DERL2Q9GZP9 239 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SGK2Q9HBY8 427 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 IRAK2O43187 625 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 C22orf31O95567 290 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 S1PR4O95977 384 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FHP07954 510 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HTR6P50406 440 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BEND5Q7L4P6 421 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BTLAQ7Z6A9 289 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ELMOD1Q8N336 334 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DTX3Q8N9I9 347 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GANCQ8TET4 914 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SGCDQ92629 289 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 VAPAQ9P0L0 249 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TLR4O00206 839 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 APOL3O95236 402 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CKMP06732 381 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CD1EP15812 388 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MAGEA3P43357 314 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CENPAP49450 140 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GRIK2Q13002 908 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 XKRXQ6PP77 449 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 Q8N402 240 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZBTB2Q8N680 514 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FAM110BQ8TC76 370 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PTERQ96BW5 349 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MIOSQ9NXC5 875 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RHCGQ9UBD6 479 aa14.69□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PTGER3P43115 390 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CPT1AP50416 773 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CLCNKBP51801 687 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TBPL2Q6SJ96 375 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CLEC14AQ86T13 490 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 REPS1Q96D71 796 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CCDC32Q9BV29 185 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CD300AQ9UGN4 299 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HCN2Q9UL51 889 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 EDN1P05305 212 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KDELR2P33947 212 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 C2orf80Q0P641 193 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MFSD10Q14728 455 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FEVQ99581 238 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NMUR1Q9HB89 426 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DHRS7Q9Y394 339 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CPN2P22792 545 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RCAN2Q14206 197 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PARP15Q460N3 678 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KRT78Q8N1N4 520 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GULP1Q9UBP9 304 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BEST1O76090 585 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 STOMP27105 288 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NAE1Q13564 534 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF767PQ75MW2 155 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms