RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 UROSP10746 265 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 EMX2Q04743 252 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM26Q6ZUK4 368 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PIM3Q86V86 326 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CHPT1Q8WUD6 406 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RIC8BQ9NVN3 520 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPC4 97 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PPW3 197 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM234BA2RU67 622 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS23O95084 383 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF1P05230 155 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00032P0C843 101 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ARSDP51689 593 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NFATC3Q12968 1075 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4D1Q15615 310 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF549Q6P9A3 640 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HORMAD1Q86X24 394 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO39Q8N4B4 442 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HCAR2Q8TDS4 363 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC6A18Q96N87 628 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 XPAP23025 273 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDH3A2P51648 485 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR5P51681 352 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXA1P55317 472 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 XKR7Q5GH72 579 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC12Q5T9G4 340 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf87Q6PH81 154 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM69Q86WT6 500 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 DPP10Q8N608 796 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB7BQ96AH8 199 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPKCQ96DU7 683 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A3Q99726 388 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PCED1AQ9H1Q7 454 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMA4GQ9NTN9 838 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYL1Q9Y2S2 319 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD51BO15315 384 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS17P08708 135 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A1P22309 533 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A4P22310 534 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CD27P26842 260 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A3P35503 534 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 UGT1A5P35504 534 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP12P39900 470 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-8P63133 956 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX3Q13185 183 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TYSND1Q2T9J0 566 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 FGD3Q5JSP0 725 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 DCDC5Q6ZRR9 648 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 HID1Q8IV36 788 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMKLAQ8IXN7 391 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB14Q8TBM8 379 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 EXT2Q93063 718 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TM9SF3Q9HD45 589 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALT6Q9UBX8 382 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 H0Y8X5 98 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX2O60749 519 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC4A1P02730 911 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 OCM2P0CE71 109 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNT3Q14435 633 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00299Q6ZSB3 139 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN33Q86UF1 283 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NSMCE2Q96MF7 247 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CHID1Q9BWS9 393 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF112Q9ULX5 631 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPAN6O43657 245 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCB7O75027 752 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 KATNA1O75449 491 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAP29O95721 258 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL10O95999 233 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM61Q5EBN2 209 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC23Q5W5X9 447 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 OFCC1Q8IZS5 231 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIB3Q96RU7 358 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC17A9Q9BYT1 436 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-201ENST00000246533 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.684e-11■□□□□ 10.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PSME2Q9UL46 239 aa25.53■■□□□ 1.68
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