RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	MARK1	Q9P0L2	795 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659		A6NL46	340 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659		H7C0S8	307 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MED26	O95402	600 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GK	P32189	559 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MC4R	P32245	332 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC26A3	P40879	764 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TRAF3	Q13114	568 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC51B	Q86UW2	128 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PAF1	Q8N7H5	531 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SETD6	Q8TBK2	473 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMBIM1	Q969X1	311 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MOCOS	Q96EN8	888 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GON7	Q9BXV9	100 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IL17C	Q9P0M4	197 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PKP3	Q9Y446	797 aa		14.91	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC154	A6NI56	674 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZW10	O43264	779 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFS3	O75489	264 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ALPI	P09923	528 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	JUND	P17535	347 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINA4	P29622	427 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	S100A5	P33763	92 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LIPE	Q05469	1076 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CD47	Q08722	323 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP6	Q16828	381 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IMPG1	Q17R60	797 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CEP78	Q5JTW2	689 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF691	Q5VV52	312 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NEK5	Q6P3R8	708 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STK32C	Q86UX6	486 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ESX1	Q8N693	406 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AMER2	Q8N7J2	671 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MARVELD3	Q96A59	401 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BIRC7	Q96CA5	298 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RNF145	Q96MT1	663 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	APOL4	Q9BPW4	351 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659		G3V2T6	193 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	UPK1A	O00322	258 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TBX1	O43435	398 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TRBC1	P01850	177 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	YES1	P07947	543 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CAPN3	P20807	821 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HMGCL	P35914	325 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PBX2	P40425	430 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HTR3A	P46098	478 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NRIP1	P48552	1158 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SUOX	P51687	545 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR2B6	P58173	313 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MEP1A	Q16819	746 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CDON	Q4KMG0	1287 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FIG4	Q92562	907 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FCGR1B	Q92637	280 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LGALS12	Q96DT0	336 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NTN4	Q9HB63	628 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ACSS2	Q9NR19	701 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SCN3B	Q9NY72	215 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		14.9	□□□□□ -0.02
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0U1RQS6	177 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PP18	115 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CCRL2	O00421	344 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC16A6	O15403	523 aa		14.89	□□□□□ -0.03

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