RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NR4A3	Q92570	626 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MIEF2	Q96C03	454 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	LMF1	Q96S06	567 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.38	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GUH1	482 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQ72	361 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2A25	A4D2G3	310 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	IDS	B3KWA1	339 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FKBP9	O95302	570 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ETS1	P14921	441 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ADRA1D	P25100	572 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAME	P78395	509 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ARG2	P78540	354 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TMED2	Q15363	201 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RELT	Q969Z4	430 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC1	Q99614	292 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	COPG2	Q9UBF2	871 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	HIVEP1	P15822	2718 aa		11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNA1C	Q13936	2221 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338		F8W8V4	182 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	WISP2	O76076	250 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	USP1	O94782	785 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNB1	P01574	187 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MST1	P26927	711 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CRADD	P78560	199 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	OCA2	Q04671	838 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	HKDC1	Q2TB90	917 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	AMER3	Q8N944	861 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.36	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	DYTN	A2CJ06	578 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338		H0YGG7	62 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59

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