RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597781.5

SMIM7-215, Transcript of small integral membrane protein 7, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM7, Length 975 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7-215ENST00000597781 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 XPR1Q9UBH6 696 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 KLK4Q9Y5K2 254 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM7-215ENST00000597781 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CEP250Q9BV73 2442 aa7.4□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 A0A0J9YY10 115 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TARM1B6A8C7 271 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 UBXN8O00124 270 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TK2O00142 265 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 STX16O14662 325 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TAPBPO15533 448 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PLIN3O60664 434 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CSO75390 466 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 STK16O75716 305 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 RASSF9O75901 435 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PROCP04070 461 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SBK3P0C264 359 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 GFAPP14136 432 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CDH3P22223 829 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 HRH2P25021 359 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 MPSTP25325 297 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CMPK1P30085 196 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SLC6A12P48065 614 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PDX1P52945 283 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PPP1CAP62136 330 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TBPL1P62380 186 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 NFKB2Q00653 900 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SETDB1Q15047 1291 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PFKFB4Q16877 469 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PHF19Q5T6S3 580 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 C16orf46Q6P387 395 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 LCTLQ6UWM7 567 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 EXOC3L1Q86VI1 746 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 FBXO39Q8N4B4 442 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TEX19Q8NA77 164 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 OR2L3Q8NG85 312 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 RDH11Q8TC12 318 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 UBTD2Q8WUN7 234 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 EXT2Q93063 718 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ZUFSPQ96AP4 578 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TLCD1Q96CP7 247 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 MED8Q96G25 268 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 MAP3K3Q99759 626 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 MIPEPQ99797 713 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 SH3GL2Q99962 352 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CD244Q9BZW8 370 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 KLHL3Q9UH77 587 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 TAC3Q9UHF0 121 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 MID2Q9UJV3 735 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 EMCNQ9ULC0 261 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 PLLPQ9Y342 182 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM7-215ENST00000597781 AK5Q9Y6K8 562 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms