RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ATG9BQ674R7 924 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 VRK3Q8IV63 474 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GTF3C1Q12789 2109 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC162PA2VCL2 907 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MROH6A6NGR9 719 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IDSB3KWA1 339 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TJP3O95049 919 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ANXA5P08758 320 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MST1P26927 711 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PSMB5P28074 263 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NAA25Q14CX7 972 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 KCTD11Q693B1 232 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 AFTPHQ6ULP2 937 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LINC00523Q86TU6 105 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CNGA4Q8IV77 575 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PSMF1Q92530 271 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MAGED4Q96JG8 741 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MENTQ9BUN1 341 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SLC19A2O60779 497 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PRAMEF2O60811 474 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GOT2P00505 430 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ICAM2P13598 275 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RWDD2BP57060 319 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PRAMEP78395 509 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF33BQ06732 778 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 VSTM4Q8IW00 320 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HDAC10Q969S8 669 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FOPNLQ96NB1 174 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZFHX3Q15911 3703 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TACC2O95359 2948 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HIVEP1P15822 2718 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR5H15A6NDH6 313 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IQCF5A8MTL0 148 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FFAR3O14843 346 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GPR42O15529 346 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 VPS26AO75436 327 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GPC4O75487 556 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MED26O95402 600 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 METTL18O95568 372 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MLYCDO95822 493 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CELA2AP08217 269 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ITGAMP11215 1152 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PTPN7P35236 360 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 BDKRB1P46663 353 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GRB7Q14451 532 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CEP97Q8IW35 865 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR2L3Q8NG85 312 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR4L1Q8NH43 312 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CARD6Q9BX69 1037 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RNF32Q9H0A6 362 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 STMN3Q9NZ72 180 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TINAGQ9UJW2 476 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FAM227AF5H4B4 570 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CAPN3P20807 821 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 AGAP20933 346 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 AOAHP28039 575 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CMPK1P30085 196 aa14.48□□□□□ -0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PMP22Q01453 160 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms