RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585313.5

IFT20-215, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

APPRIS P4 TSL 3 BASIC

Gene IFT20, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-215ENST00000585313 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PELI2Q9HAT8 420 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 BRF2Q9HAW0 419 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 C1orf109Q9NX04 203 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PLAGL1Q9UM63 463 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GPR45Q9Y5Y3 372 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 A0A1W2PR77 199 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 BBIP1A8MTZ0 92 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MEI4A8MW99 385 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 H0YHG0 523 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 F3P13726 295 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLC2A4P14672 509 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PXNP49023 591 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RACK1P63244 317 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KCNJ2P63252 427 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MXRA7P84157 204 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 STX5Q13190 355 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RPS6KA2Q15349 733 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 AGKQ53H12 422 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MED27Q6P2C8 311 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 C17orf64Q86WR6 236 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 NRROSQ86YC3 692 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ACPTQ9BZG2 426 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 NDE1Q9NXR1 346 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 THADAQ6YHU6 1953 aa16.04■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 AK4P27144 223 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MAPK1P28482 360 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CD38P28907 300 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SHMT2P34897 504 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CPOXP36551 454 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CUL3Q13618 768 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SGO1Q5FBB7 561 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SUSD1Q6UWL2 747 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GK5Q6ZS86 529 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 LAS2Q8IYD9 372 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PHACTR4Q8IZ21 702 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FAM9CQ8IZT9 166 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ZFPM2Q8WW38 1151 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HBEGFQ99075 208 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ICKQ9UPZ9 632 aa16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 A0A1W2PPV9 198 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 OR5K4A6NMS3 321 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SCAMP1O15126 338 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GSC2O15499 205 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KRT34O76011 436 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KRT16P08779 473 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 DIO3P55073 304 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PHEXP78562 749 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HMGCS1Q01581 520 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 LONP2Q86WA8 852 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KRT78Q8N1N4 520 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FCRL1Q96LA6 429 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HSPA12BQ96MM6 686 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CD320Q9NPF0 282 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PPT2Q9UMR5 302 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms