RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582892.1

NF1-222, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 4

Gene NF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-222	ENST00000582892	KDELC1	Q6UW63	502 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	CES3	Q6UWW8	571 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	RAPH1	Q70E73	1250 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	TEX26	Q8N6G2	289 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	CHST14	Q8NCH0	376 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	DLG3	Q92796	817 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	TADA1	Q96BN2	335 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	BTBD9	Q96Q07	612 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	FICD	Q9BVA6	458 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	STRADB	Q9C0K7	418 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	VPS4A	Q9UN37	437 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	CDYL	Q9Y232	598 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		7.22	□□□□□ -1.25
NF1-222	ENST00000582892	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	IQCJ-SCHIP1	C9J366	451 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	LMO7DN	F2Z398	122 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	STMND1	H3BQB6	276 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	DFFA	O00273	331 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	GRID2	O43424	1007 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ZBTB14	O43829	449 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	PIGN	O95427	931 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	LATS1	O95835	1130 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	LDLR	P01130	860 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	EPO	P01588	193 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ARNT	P27540	789 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	PIK3R1	P27986	724 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	GABRB3	P28472	473 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	UGT1A3	P35503	534 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ATP4B	P51164	291 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SESN3	P58005	492 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SLC25A3	Q00325	362 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ACVR1	Q04771	509 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	CDC20	Q12834	499 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	OLIG2	Q13516	323 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	CCNI	Q14094	377 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	DLG2	Q15700	870 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	MPP7	Q5T2T1	576 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	PHF19	Q5T6S3	580 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	NEPRO	Q6NW34	567 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	KLC3	Q6P597	504 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	GPR150	Q8NGU9	434 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	WDR48	Q8TAF3	677 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	AZIN2	Q96A70	460 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	SCYL1	Q96KG9	808 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ZNF599	Q96NL3	588 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		7.21	□□□□□ -1.26
NF1-222	ENST00000582892	RDH14	Q9HBH5	336 aa		7.21	□□□□□ -1.26

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