RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A18Q9H1K4 315 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 MMP27Q9H306 513 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 RGCCQ9H4X1 137 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 CAB39LQ9H9S4 337 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 FOLH1BQ9HBA9 442 aa2.98□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC28Q9NX36 388 aa2.98□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa2.98□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 NPHP3Q7Z494 1330 aa2.97□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 PEPDP12955 493 aa2.97□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 MPLP40238 635 aa2.97□□□□□ -1.93
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PTPRM-204ENST00000577468 NPY2RP49146 381 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PTPRM-204ENST00000577468 LIG4P49917 911 aa2.97□□□□□ -1.93
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