RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 INHBBP09529 407 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS56P0CW18 603 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD46P15529 392 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ITGALP20701 1170 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 DNASE1P24855 282 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PKLRP30613 574 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MPP3Q13368 585 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 BRD3Q15059 726 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACER2Q5QJU3 275 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 H3F3CQ6NXT2 135 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 NUDT8Q8WV74 236 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF354BQ96LW1 612 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 C10orf90Q96M02 699 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 NPAS2Q99743 824 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 FICDQ9BVA6 458 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 LRFN1Q9P244 771 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.89□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 STAB1Q9NY15 2570 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A0J9YVX5 310 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 C5orf60A6NFR6 353 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 KLK8O60259 260 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 NRP2O60462 931 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 HEXAP06865 529 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TPOP07202 933 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SP1P08047 785 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSTM1P09488 218 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD9P21926 228 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ACRV1P26436 265 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTGER1P34995 402 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 DGKQP52824 942 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 GSTM4Q03013 218 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MUM1Q2TAK8 710 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPR33Q49SQ1 333 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CD163Q86VB7 1156 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF567Q8N184 647 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMER3Q8N944 861 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMEM178AQ8NBL3 297 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ELMO1Q92556 727 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 RND1Q92730 232 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC22A18Q96BI1 424 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MBD6Q96DN6 1003 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 IL17FQ96PD4 163 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SCN3AQ9NY46 2000 aa9.88□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 A0A1B0GTH9 108 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TARM1B6A8C7 271 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 RASGRF2O14827 1237 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 KDM1AO60341 852 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 NEURL1O76050 574 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 S1PR4O95977 384 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MC4RP32245 332 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PTGS2P35354 604 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC26A3P40879 764 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARHGAP25P42331 645 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 DLX5P56178 289 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 DYNLT1P63172 113 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 GRB7Q14451 532 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 TAZQ16635 292 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 MEP1AQ16819 746 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 BTBD16Q32M84 506 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC25A25Q6KCM7 469 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 RANBP10Q6VN20 620 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 PID1Q7Z2X4 250 aa9.87□□□□□ -0.83
CTDNEP1-202ENST00000570380 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms