RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.87□□□□□ -1.31
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C4orf22Q6V702 233 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF44Q7L0R7 432 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CUZD1Q86UP6 607 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC35F6Q8N357 371 aa6.85□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.85□□□□□ -1.31
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