RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CTAGE5	O15320	804 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEB2	O15479	319 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SCGB2A1	O75556	95 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MFN2	O95140	757 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	VNN2	O95498	520 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CBX6	O95503	412 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IFNA2	P01563	188 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LCAT	P04180	440 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SKIL	P12757	684 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC130	P13994	396 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CSF2RA	P15509	400 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF18	P17022	549 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT1	P19526	365 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EDN2	P20800	178 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	JAK1	P23458	1154 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SERPINB6	P35237	376 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN1A	P38936	164 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR12	P47775	334 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ETV1	P50549	477 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	METAP1	P53582	386 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RAD23B	P54727	409 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MFAP3	P55082	362 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DLK1	P80370	383 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CDK3	Q00526	305 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LTB	Q06643	244 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIK3	Q13003	919 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT33B	Q14525	404 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPK11	Q15759	364 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SGO1	Q5FBB7	561 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR27	Q6MZM9	219 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CES3	Q6UWW8	571 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GLCT	Q6Y288	498 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MACC1	Q6ZN28	852 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DPPA4	Q7L190	304 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	BNIPL	Q7Z465	357 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR180	Q86V85	440 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TDRP	Q86YL5	185 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GPSM1	Q86YR5	675 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC43	Q8N309	656 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LEMD2	Q8NC56	503 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RLN3	Q8WXF3	142 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FIG4	Q92562	907 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LPAR1	Q92633	364 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ACOX2	Q99424	681 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG101	Q9BSB4	218 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FICD	Q9BVA6	458 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD9	Q9H257	536 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK6	Q9Y257	313 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CLIC4	Q9Y696	253 aa		2.69	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPACA6	W5XKT8	324 aa		2.69	□□□□□ -1.98

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