RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZRM9	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TSG101	Q99816	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CARD9	Q9H257	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC19	Q9H756	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CHUK	O15111	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	LDB2	O43679	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MYBL2	P10244	700 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	BRAF	P15056	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF30	P17039	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HTR7	P34969	479 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	USP8	P40818	1118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	BPIFB4	P59827	614 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PPP1CA	P62136	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	COL10A1	Q03692	680 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	USP45	Q70EL2	814 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PASD1	Q8IV76	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HAS2	Q92819	552 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NTAN1	Q96AB6	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	C18orf12	Q96KH6	178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	LHPP	Q9H008	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A1B0GVL5	298 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KMO	O15229	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF749	O43361	778 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC19A2	O60779	497 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SCFD1-223	ENST00000557076	KCNJ13	O60928	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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