RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MFSD3	Q96ES6	412 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CFAP36	Q96G28	342 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SNF8	Q96H20	258 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HGH1	Q9BTY7	390 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	XKR8	Q9H6D3	395 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	EURL	Q9NYK6	297 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RNF14	Q9UBS8	474 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ICK	Q9UPZ9	632 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ASF1A	Q9Y294	204 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	POLE	Q07864	2286 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ESPN	B1AK53	854 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ISM1	B1AKI9	464 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688		H7C0S8	307 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MASP2	O00187	686 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DSCR3	O14972	297 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HCRTR1	O43613	425 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	USP1	O94782	785 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HP	P00738	406 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FTH1	P02794	183 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CTAGE8	P0CG41	777 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	COX6B1	P14854	86 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CAPN3	P20807	821 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	AGA	P20933	346 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ADRA1D	P25100	572 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IVD	P26440	423 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ACADL	P28330	430 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NSG1	P42857	185 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GCGR	P47871	477 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CASP6	P55212	293 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	AP2B1	P63010	937 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ARG2	P78540	354 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GUCY2D	Q02846	1103 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RBPJ	Q06330	500 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SLC9A5	Q14940	896 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RBBP7	Q16576	425 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TEX35	Q5T0J7	233 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CCDC25	Q86WR0	208 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NR4A3	Q92570	626 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HAS2	Q92819	552 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HDAC10	Q969S8	669 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	FAM136A	Q96C01	138 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	LURAP1	Q96LR2	239 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SPSB2	Q99619	263 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CUTC	Q9NTM9	273 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	BFAR	Q9NZS9	450 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		6.56	□□□□□ -1.36
CS-233	ENST00000552688	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		6.56	□□□□□ -1.36

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