RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552000.2

HOXB3-213, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB3, Length 466 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-213ENST00000552000 CBX8Q9HC52 389 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 PLCL2Q9UPR0 1127 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ANK2Q01484 3957 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 A0A0J9YY10 115 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NPIPA5E9PKD4 350 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SGTAO43765 313 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ZWINTO95229 277 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 PRAMEF1O95521 474 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SERPINA7P05543 415 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ABOP16442 354 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 FERP16591 822 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 IGFBP2P18065 325 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MCM3P25205 808 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 HMGCLP35914 325 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NSG1P42857 185 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 FOLH1Q04609 750 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CACNG1Q06432 222 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 KLC1Q07866 573 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MYBPHQ13203 477 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ITGA9Q13797 1035 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 DPYSL3Q14195 570 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 TCEAL1Q15170 157 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 DPCR1Q3MIW9 517 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 BCL7AQ4VC05 210 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 TMEM198Q66K66 360 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CNSTQ6PJW8 725 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 UNC5AQ6ZN44 842 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NDUFAF7Q7L592 441 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 AMER2Q8N7J2 671 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 HM13Q8TCT9 377 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 GPR137Q96N19 417 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SMR3AQ99954 134 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SYT11Q9BT88 431 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CUTCQ9NTM9 273 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 FANCLQ9NW38 375 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 EURLQ9NYK6 297 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 UBP1Q9NZI7 540 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 IL17CQ9P0M4 197 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 C3orf18Q9UK00 162 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 PPT2Q9UMR5 302 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NPIPA1Q9UND3 350 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ICKQ9UPZ9 632 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 SCINQ9Y6U3 715 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ALPK2Q86TB3 2170 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 MED12Q93074 2177 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 EML6Q6ZMW3 1958 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 HEATR5AQ86XA9 2040 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 KLHL33A6NCF5 533 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 OR5H15A6NDH6 313 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 VSTM2BA6NLU5 285 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 FOXO6A8MYZ6 492 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 E9PLN8 166 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ADAM10O14672 748 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 DSCR3O14972 297 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 TTI1O43156 1089 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 BMP10O95393 424 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 ONECUT2O95948 504 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 TPM2P07951 284 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-213ENST00000552000 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms