RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 G2E3Q7L622 706 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM219AQ8IW50 185 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK20Q8IZL9 346 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DCLK2Q8N568 766 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAD54LQ92698 747 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PROX1Q92786 737 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAC1Q96KF2 57 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 C10orf90Q96M02 699 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPAG5Q96R06 1193 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP3K3Q99759 626 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC3Q9BQI4 270 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MGME1Q9BQP7 344 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FSD1Q9BTV5 496 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TUBB2BQ9BVA1 445 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACTL8Q9H568 366 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TXLNGQ9NUQ3 528 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF186Q9NXI6 227 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM181Q9P2C4 612 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANAPC5Q9UJX4 755 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.38□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A087WW49 117 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTR3EA5X5Y0 456 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 C5orf52A6NGY3 159 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 EDIL3O43854 480 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOCS5O75159 536 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPS6KA5O75582 802 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT33AO76009 404 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZFAND5O76080 213 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GBAP04062 536 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GLULP15104 373 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDGFRAP16234 1089 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RGS7P49802 495 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MFAP3P55082 362 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTCP1P56278 107 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPARDQ03181 441 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNK1Q13470 666 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITGA9Q13797 1035 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SQLEQ14534 574 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 EXT1Q16394 746 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAZQ16635 292 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GTDC1Q4AE62 458 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARMC3Q5W041 872 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOTUMQ6P988 496 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ENPP7Q6UWV6 458 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL23Q86XA0 190 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIGD4Q8IY51 512 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDHD1Q8NEL9 900 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KBTBD8Q8NFY9 601 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR13C3Q8NGS6 347 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1L3Q8NH93 324 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNE4Q8WWG9 221 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUSD6Q92537 303 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NSMAFQ92636 917 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM162AQ96A26 154 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PANK2Q9BZ23 570 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 THAP2Q9H0W7 228 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHST11Q9NPF2 352 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHKBQ9Y259 395 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL16Q14005 1332 aa2.37□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MEIOCA2RUB1 952 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR46O15213 610 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRAF2O60831 178 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLV1-44P01699 117 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMBSP08397 361 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM58BPP0C7Q3 252 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPY3P0CV98 308 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSPY8P0CW00 308 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DARSP14868 501 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALDH4A1P30038 563 aa2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms