RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DPF3	Q92784	378 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SCAMP4	Q969E2	229 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM203	Q969S6	136 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ARMC5	Q96C12	935 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	COCH	O43405	550 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	LDB2	O43679	373 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SSNA1	O43805	119 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CLPX	O76031	633 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	INMT	O95050	263 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KLK1	P06870	262 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RFC2	P35250	354 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEA11	P43364	429 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PREP	P48147	710 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		7.85	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MYADML2	A6NDP7	307 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	WNT9A	O14904	365 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CNMD	O75829	334 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	IDS	P22304	550 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	HTR1B	P28222	390 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DGKG	P49619	791 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	HNMT	P50135	292 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	VBP1	P61758	197 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TAZ	Q16635	292 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TPGS2	Q68CL5	300 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PTER	Q96BW5	349 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF221	Q9UK13	617 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TRBC2	A0A5B9	178 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	URAD	A6NGE7	173 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SLC31A1	O15431	190 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CHRNA1	P02708	482 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ACR	P10323	421 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	BCKDHA	P12694	445 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	BDKRB1	P46663	353 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FOXA1	P55317	472 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CDK6	Q00534	326 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TLE2	Q04725	743 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SCN1B	Q07699	218 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ATP6AP1	Q15904	470 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MOG	Q16653	247 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NEK5	Q6P3R8	708 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF534	Q76KX8	674 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		7.84	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.84	□□□□□ -1.15

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