RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CDC23Q9UJX2 597 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE10AQ9Y233 779 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK4Q9Y5K2 254 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNMB2Q9Y691 235 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN3AQ9NY46 2000 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2A25A4D2G3 310 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CCR10P46092 362 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NFATC3Q12968 1075 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CHAF1BQ13112 559 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CBLBQ13191 982 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNAB2Q13303 367 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP19Q14CB8 494 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT8Q16880 541 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ICE2Q659A1 982 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM45BPQ6NSW5 357 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM207Q6UWW9 146 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 STRA8Q7Z7C7 330 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SYVN1Q86TM6 617 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM45AQ8TCE6 357 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF285Q96NJ3 590 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 MCMBPQ9BTE3 642 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 GPR87Q9BY21 358 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NLNQ9BYT8 704 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM55Q9BYV6 548 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A11Q9NSA0 550 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TCFL5Q9UL49 500 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX7Q9UNH6 387 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 POLHQ9Y253 713 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 BAHCC1Q9P281 2608 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 URI1O94763 535 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 FKBP9O95302 570 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 C1QAP02745 245 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB40ALP0C0E4 278 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NR1D1P20393 614 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SAT1P21673 171 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CMPK1P30085 196 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PLTPP55058 493 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 GPX6P59796 221 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS15P62841 145 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 C19orf57Q0VDD7 668 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT3A1Q6NUS8 523 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TLDC1Q6P9B6 456 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TTLL10Q6ZVT0 673 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PAQR7Q86WK9 346 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO1HQ8N1T3 1032 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PYROXD1Q8WU10 500 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF592Q92610 1267 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SRPK3Q9UPE1 567 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 DOCK10Q96BY6 2186 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TARM1B6A8C7 271 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 K7EM74 188 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB14O43829 449 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 HBQ1P09105 142 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS4P49798 205 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 SP140Q13342 867 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.461e-7■■□□□ 12
SH3BP2-218ENST00000511185 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF425Q6IV72 752 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 C8orf74Q6P047 294 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 COX15Q7KZN9 410 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC25Q86WR0 208 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PLD3Q8IV08 490 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PROKR1Q8TCW9 393 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 ZUFSPQ96AP4 578 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS39Q96JC1 886 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 PLCD4Q9BRC7 762 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC1Q9BTT6 524 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NDC1Q9BTX1 674 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB17Q9H0T7 212 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 TXLNGQ9NUQ3 528 aa17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SH3BP2-218ENST00000511185 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP2-218ENST00000511185 C9J4A7 227 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP2-218ENST00000511185 NDC80O14777 642 aa17.89■□□□□ 0.45
SH3BP2-218ENST00000511185 HAT1O14929 419 aa17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms