RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503791.5

PAN3-204, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

TSL 2

Gene PAN3, Length 2,443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PAN3-204ENST00000503791 SLC19A1P41440 591 aa22.99■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 CCL15Q16663 113 aa22.99■■□□□ 1.27
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PAN3-204ENST00000503791 IL7P13232 177 aa22.96■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 TNFSF8P32971 234 aa22.96■■□□□ 1.27
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PAN3-204ENST00000503791 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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PAN3-204ENST00000503791 ULK1O75385 1050 aa22.96■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 DNTTP04053 509 aa22.96■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 KDELR2P33947 212 aa22.96■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 ZNF235Q14590 738 aa22.96■■□□□ 1.27
PAN3-204ENST00000503791 VMACQ2NL98 169 aa22.96■■□□□ 1.27
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