RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 TMED2Q15363 201 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TPSAB1Q15661 275 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MSS51Q4VC12 460 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TLDC1Q6P9B6 456 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PTERQ96BW5 349 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 IL22Q9GZX6 179 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 BFARQ9NZS9 450 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TAC3Q9UHF0 121 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NBASA2RRP1 2371 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OR2A25A4D2G3 310 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 USP27XA6NNY8 438 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PEX12O00623 359 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 HAT1O14929 419 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNHIT1O43257 154 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NRDCO43847 1150 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DPM1O60762 260 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CBX6O95503 412 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SLC16A8O95907 504 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 HBQ1P09105 142 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GABRB3P28472 473 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CYP2A13Q16696 494 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 FHL5Q5TD97 284 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NEPROQ6NW34 567 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RNF44Q7L0R7 432 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NLRP9Q7RTR0 991 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CTAGE6Q86UF2 777 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PAQR7Q86WK9 346 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 REXO1L1PQ8IX06 675 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SLC35F6Q8N357 371 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 AMER3Q8N944 861 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF480Q8WV37 535 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SEC14L1Q92503 715 aa8.49□□□□□ -1.05
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HDAC3-211ENST00000491581 CNDP1Q96KN2 507 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SERPINB12Q96P63 405 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PANX3Q96QZ0 392 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TTC1Q99614 292 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GPR21Q99679 349 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 YIPF2Q9BWQ6 316 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PCYOX1Q9UHG3 505 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PTPN13Q12923 2485 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SEC16AO15027 2179 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 FEZF1A0PJY2 475 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CTAGE9A4FU28 777 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 FITM1A5D6W6 292 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 FOXS1O43638 330 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PIAS1O75925 651 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 USP1O94782 785 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ERVK-10P10266 1014 aa8.48□□□□□ -1.05
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