RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SIAH3Q8IW03 269 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 NCOA7Q8NI08 942 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LMO3Q8TAP4 145 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA20Q8TB22 786 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CENPTQ96BT3 561 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SGF29Q96ES7 293 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ACTL8Q9H568 366 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 DBNDD1Q9H9R9 158 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CNIH4Q9P003 139 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 STUB1Q9UNE7 303 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 OVOL3O00110 214 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 O00370 1275 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CRCPO75575 148 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RAD51DO75771 328 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 STAG3L1P0CL83 205 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CA6P23280 308 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KHKP50053 298 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 HERV-K104P61576 105 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 OR52N5Q8NH56 324 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PYCR2Q96C36 320 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 WACQ9BTA9 647 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CDK19Q9BWU1 502 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TLE6Q9H808 572 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CHST11Q9NPF2 352 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RTN2O75298 545 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CAVIN2O95810 425 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SLC16A8O95907 504 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LIFP15018 202 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 AMD1P17707 334 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DPA1P20036 260 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TAF10Q12962 218 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 FHL1Q13642 323 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 UGP2Q16851 508 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ANO5Q75V66 913 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 EID3Q8N140 333 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ITM2BQ9Y287 266 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 DOCK7Q96N67 2140 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ACEP12821 1306 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ILVBLA1L0T0 632 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 UROSP10746 265 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CASP3P42574 277 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IER3P46695 156 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 FOLH1Q04609 750 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF585BQ52M93 769 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 C9orf139Q6ZV77 190 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KRT35Q92764 455 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CABS1Q96KC9 395 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K3Q99759 626 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SDCBP2Q9H190 292 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 FLRT3Q9NZU0 649 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CHKBQ9Y259 395 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IL16Q14005 1332 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PRV1 198 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 F8VVB4 439 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 F8VWA3 439 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PNPP00491 289 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1E1P36543 226 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALT5-AS1P59052 145 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 IL10RBQ08334 325 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TECRLQ5HYJ1 363 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 C20orf194Q5TEA3 1177 aa7.03□□□□□ -1.28
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