RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	HERC3	Q15034	1050 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NOTUM	Q6P988	496 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	BAD	Q92934	168 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RHCG	Q9UBD6	479 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	IQGAP1	P46940	1657 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	KIF1B	O60333	1816 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRPM2	O94759	1503 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CEACAM4	O75871	244 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBL4A	P11441	157 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	HSD3B1	P14060	373 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC6A6	P31641	620 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GAD1	Q99259	594 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NOS1	P29475	1434 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PLA2R1	Q13018	1463 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NLRP1	Q9C000	1473 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	EPHB6	O15197	1021 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	HDAC3	O15379	428 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GPC4	O75487	556 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	POC5	Q8NA72	575 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PERP	Q96FX8	193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPAG5	Q96R06	1193 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATF6B	Q99941	703 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GGA3	Q9NZ52	723 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		3.09	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	IFT172	Q9UG01	1749 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPL	O60437	1756 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123		G3V2L1	256 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGKV3-11	P04433	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	TNFAIP3	P21580	790 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRELP	P51888	382 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	IDI1	Q13907	227 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	DLG2	Q15700	870 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPECC1	Q5M775	1068 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SETD4	Q9NVD3	440 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARID1A	O14497	2285 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	HYKK	A2RU49	373 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	KHK	P50053	298 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	MELK	Q14680	651 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF74	Q16587	644 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	HTRA1	Q92743	480 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	OSER1	Q9NX31	292 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLIT1	O75093	1534 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SUCLG1-208	ENST00000491123	PTPRT	O14522	1441 aa		3.06	□□□□□ -1.92

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