RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 IRF9Q00978 393 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 NAB1Q13506 487 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CSHL1Q14406 222 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR4D1Q15615 310 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 BROXQ5VW32 411 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ICE2Q659A1 982 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PLD3Q8IV08 490 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 DTWD1Q8N5C7 304 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PTERQ96BW5 349 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PRORYQ9H606 182 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PLCL2Q9UPR0 1127 aa11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 V9GYY5 206 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR2A25A4D2G3 310 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 TARM1B6A8C7 271 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 E7EQ34 232 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 H7BY64 318 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 MAP3K7O43318 606 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 RIPK2O43353 540 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR2B3O76000 313 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 MED26O95402 600 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CD1DP15813 335 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 HIST1H2ADP20671 130 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 GCAP28676 217 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 HSD17B2P37059 387 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 STAT5AP42229 794 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CSRP3P50461 194 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ATP1A2P50993 1020 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 FBXO48Q5FWF7 155 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 C1orf189Q5VU69 101 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ZNF425Q6IV72 752 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 RAPH1Q70E73 1250 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PAQR7Q86WK9 346 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ESX1Q8N693 406 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR8K5Q8NH50 307 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR56A3Q8NH54 315 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CT55Q8WUE5 264 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 SLC44A1Q8WWI5 657 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 FBXL8Q96CD0 374 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 NXNL1Q96CM4 212 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OR4K3Q96R72 315 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PAFAH2Q99487 392 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 HIST1H2AJQ99878 128 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PLCD4Q9BRC7 762 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 H2AFJQ9BTM1 129 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 SGPP1Q9BX95 441 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 DERL2Q9GZP9 239 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 FANCEQ9HB96 536 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 LHX9Q9NQ69 397 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PCMTD2Q9NV79 361 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CROTQ9UKG9 612 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 LHX6Q9UPM6 363 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 OARD1Q9Y530 152 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 KLK4Q9Y5K2 254 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PKD1L2Q7Z442 2459 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.63□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ZZEF1O43149 2961 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 ZNF839A8K0R7 811 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 K7ENP7 123 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 MEN1O00255 615 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 HAT1O14929 419 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-210ENST00000488157 STATHP02808 62 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms