RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, human

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OPTN-209	ENST00000469025	QSOX1	O00391	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	KDM1A	O60341	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	ULK1	O75385	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MED24	O75448	989 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FKBP9	O95302	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MT-CO1	P00395	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	GNPDA1	P46926	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CAPZB	P47756	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FOXO1	Q12778	655 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MAPK7	Q13164	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	VRK3	Q8IV63	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MUC2	Q02817	5179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TIMM23	O14925	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	EML2	O95834	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TGM6	O95932	706 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HP	P00738	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	P4HA1	P13674	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	AMD1	P17707	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TPSB2	P20231	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MX1	P20591	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FOXL2	P58012	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	DCDC1	P59894	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HSD11B2	P80365	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HSPB2	A8KAH6	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025		E7ENQ6	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025		K7ERQ8	282 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	B3GALT2	O43825	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TMEM127	O75204	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HBQ1	P09105	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	FAM200B	P0CF97	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	PRR35	P0CG20	571 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	SLC25A16	P16260	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TFEB	P19484	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	BMP5	P22003	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	MESD	Q14696	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	HSPB2	Q16082	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
OPTN-209	ENST00000469025	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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