RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 CCND1P24385 295 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 PKLRP30613 574 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 PGM1P36871 562 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 NEK2P51955 445 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 RAP1GDS1P52306 607 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 NME5P56597 212 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 MTAPQ13126 283 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 KIAA0040Q15053 153 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 RPE65Q16518 533 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 ATG9BQ674R7 924 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 NRROSQ86YC3 692 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 CAMKK1Q8N5S9 505 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SMPDL3AQ92484 453 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SLC45A3Q96JT2 553 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 EHD1Q9H4M9 534 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 ACTL8Q9H568 366 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 LRTM1Q9HBL6 345 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf109Q9NX04 203 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 DGKBQ9Y6T7 804 aa9.22□□□□□ -0.93
SRPRB-202ENST00000466636 A0A088AWK7 358 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF839A8K0R7 811 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 A8MUI8 341 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 K7ESF4 209 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NR5A2O00482 541 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 AIM2O14862 343 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MGRN1O60291 552 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RASGRP1O95267 797 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 EML2O95834 649 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 G6PDP11413 515 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HSD3B1P14060 373 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC2A4P14672 509 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CAPN3P20807 821 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HSD3B2P26439 372 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 IL12AP29459 219 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PXNP49023 591 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT2P50583 147 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 UFM1P61960 85 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GUCA2AQ02747 115 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 STX5Q13190 355 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FZD2Q14332 565 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RPS6KA2Q15349 733 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 IMPG1Q17R60 797 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 IL23RQ5VWK5 629 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 REP15Q6BDI9 236 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RD3Q7Z3Z2 195 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HID1Q8IV36 788 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LAS2Q8IYD9 372 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DSELQ8IZU8 1212 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KYQ8NBH2 561 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TSPEARQ8WU66 669 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FCRL1Q96LA6 429 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TEX37Q96LM6 180 aa9.21□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC6A18Q96N87 628 aa9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms