RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 DSN1Q9H410 356 aa20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 DUSP21Q9H596 190 aa20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.89■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 GREM1O60565 184 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 FADS2O95864 444 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 NRIP1P48552 1158 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.88■□□□□ 0.938e-8■■■■■ 32.6
VGF-202ENST00000445482 SVOPQ8N4V2 548 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RHOXF1Q8NHV9 184 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CLIP3Q96DZ5 547 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 DKK3Q9UBP4 350 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CYP4B1P13584 511 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 BPIP17213 487 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 HMGCS1Q01581 520 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 TRAF3Q13114 568 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CHRNA6Q15825 494 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CATSPEREQ5SY80 951 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 MSRB3Q8IXL7 192 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 DPY30Q9C005 99 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SP140LQ9H930 580 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 LATS2Q9NRM7 1088 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 POU2F3Q9UKI9 436 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 AP3M1Q9Y2T2 418 aa20.88■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 TRBC1P01850 177 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 MT-ND2P03891 347 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CKMP06732 381 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 GJA1P17302 382 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ITGALP20701 1170 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 MASP1P48740 699 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CDC20Q12834 499 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 TPGS2Q68CL5 300 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RBFAQ8N0V3 343 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ZNF540Q8NDQ6 660 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 LGALS12Q96DT0 336 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 WWOXQ9NZC7 414 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 AASSQ9UDR5 926 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 IFT52Q9Y366 437 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ANKRD34BA5PLL1 514 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 GGT5P36269 586 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RGS4P49798 205 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 EPHB3P54753 998 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 CXCR4P61073 352 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 AP1S1P61966 158 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 FPGSQ05932 587 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RETSATQ6NUM9 610 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SNX20Q7Z614 316 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 INSL5Q9Y5Q6 135 aa20.87■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RGS10O43665 173 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 OTCP00480 354 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 IL6P05231 212 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PGRP06401 933 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 LACC1Q8IV20 430 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 MCFD2Q8NI22 146 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 NETO1Q8TDF5 533 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 HTRA1Q92743 480 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 PYURFQ96I23 114 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 DEFB118Q96PH6 123 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 ISPDA4D126 451 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 RGS14O43566 566 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 UPK1BO75841 260 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 GSNP06396 782 aa20.86■□□□□ 0.93
VGF-202ENST00000445482 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms