RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC14CA4D256 554 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SYF2O95926 243 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FURINP09958 794 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 AGXTP21549 392 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CMPK1P30085 196 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NCF4Q15080 339 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UGT8Q16880 541 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PAQR3Q6TCH7 311 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GPATCH11Q8N954 259 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF480Q8WV37 535 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GBP5Q96PP8 586 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 C17orf62Q9BQA9 187 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NDC1Q9BTX1 674 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB17Q9H0T7 212 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ENAMQ9NRM1 1142 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MOCS1Q9NZB8 636 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GRHL1Q9NZI5 618 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 C9J4A7 227 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 E7ENX8 843 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CTSVO60911 334 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNDBP1O95273 360 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 C8GP07360 202 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPN1P07384 714 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FDXRP22570 491 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GCGRP47871 477 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TAP2Q03519 686 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SP140Q13342 867 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IL10RAQ13651 578 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TCTE1Q5JU00 501 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 HECTD2Q5U5R9 776 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF44Q7L0R7 432 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO1HQ8N1T3 1032 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PPFIBP2Q8ND30 876 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM45AQ8TCE6 357 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PYROXD1Q8WU10 500 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DLG3Q92796 817 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LINGO1Q96FE5 620 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SELENOSQ9BQE4 189 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DPH7Q9BTV6 452 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DHRS4Q9BTZ2 278 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC6A20Q9NP91 592 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SAYSD1Q9NPB0 183 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TXLNGQ9NUQ3 528 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC23Q9UJX2 597 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SNX7Q9UNH6 387 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 VWA7Q9Y334 891 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PSAT1Q9Y617 370 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNMB2Q9Y691 235 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NOTCH2Q04721 2471 aa13.56□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2A25A4D2G3 310 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC16A5O15375 505 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPAN12O95859 305 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IMPA1P29218 277 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ARSFP54793 590 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IL2P60568 153 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 YBX1P67809 324 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 DCDP81605 110 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNAB2Q13303 367 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 GRM7Q14831 915 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 IGFBP7Q16270 282 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf189Q5VU69 101 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ICE2Q659A1 982 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 STRA8Q7Z7C7 330 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC26A11Q86WA9 606 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PALM2Q8IXS6 379 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 THAP4Q8WY91 577 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 OLFM1Q99784 485 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PHACTR1Q9C0D0 580 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC25A18Q9H1K4 315 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 PARVBQ9HBI1 364 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TAC3Q9UHF0 121 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa13.55□□□□□ -0.24
SH3BP4-205ENST00000444916 TCFL5Q9UL49 500 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms