RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CCR6P51684 374 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MAP2K6P52564 334 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FCGRTP55899 365 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CNTN1Q12860 1018 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CCINQ13939 588 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF273Q14593 569 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GANABQ14697 944 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf120Q5SQS8 335 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 AHSA2Q719I0 299 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM5Q71RC9 77 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CARM1Q86X55 608 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC10Q8N2F6 343 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PHTF2Q8N3S3 785 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRC-209ENST00000442510 ASCL3Q9NQ33 180 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TNKSO95271 1327 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC12A8A0AV02 714 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PQLC2LA1A4F0 135 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LRIT2A6NDA9 550 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ISM1B1AKI9 464 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 H0YGN5 161 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OR10H3O60404 316 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TLR5O60602 858 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 REM1O75628 298 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 POP7O75817 140 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SCGNO76038 276 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SCGB1D1O95968 90 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 OAS1P00973 400 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RLN1P04808 185 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CREB1P16220 341 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BMP6P22004 513 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CBLP22681 906 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SLC26A5P58743 744 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PSPHP78330 225 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FOXO4P98177 505 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SP2Q02086 613 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 HNF4GQ14541 408 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GPR19Q15760 415 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TCEAL5Q5H9L2 206 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LEMD1Q68G75 181 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NRARPQ7Z6K4 114 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LYSMD2Q8IV50 215 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 EXO5Q9H790 373 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 USP18Q9UMW8 372 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 NFS1Q9Y697 457 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 V9GYS6 101 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CUX1P39880 1505 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RCCD1A6NED2 376 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM77I1YAP6 450 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 PPM1DO15297 605 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SPDEFO95238 335 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CYBBP04839 570 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 BMP4P12644 408 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 IGFBP5P24593 272 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 GZMKP49863 264 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CTBP2P56545 445 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RHDQ02161 417 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 DSC2Q02487 901 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RAB31Q13636 194 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RAB11BQ15907 218 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM35AQ53FP2 167 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 CLLU1Q5K131 121 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FUT10Q6P4F1 479 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM12Q96EX1 92 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 KCNMB3Q9NPA1 279 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRC-209ENST00000442510 RAB6BQ9NRW1 208 aa5.47□□□□□ -1.53
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