RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC38A9Q8NBW4 561 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DPH7Q9BTV6 452 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DERL2Q9GZP9 239 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATG10Q9H0Y0 220 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NRP2O60462 931 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CTSVO60911 334 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GUCA1CO95843 209 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM153BP0C7A2 387 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCNYL3P0C7X3 344 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC166P0CW27 439 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 WT1P19544 449 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VAC14Q08AM6 782 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM153CQ494X1 144 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SPATA6LQ8N4H0 392 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LHX9Q9NQ69 397 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ANKMY1Q9P2S6 941 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LHX6Q9UPM6 363 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR2A25A4D2G3 310 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 K7ENP7 123 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF749O43361 778 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABATP80404 500 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPS2Q13227 327 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NAE1Q13564 534 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BMPR2Q13873 1038 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARHGAP40Q5TG30 622 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXL8Q96CD0 374 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLIP3Q96DZ5 547 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MED8Q96G25 268 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PADI1Q9ULC6 663 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OARD1Q9Y530 152 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ITPR1Q14643 2758 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HMX2A2RU54 273 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CD1DP15813 335 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MROH9Q5TGP6 573 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RAPH1Q70E73 1250 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF44Q7L0R7 432 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC44A1Q8WWI5 657 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UBXN10Q96LJ8 280 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LRFN5Q96NI6 719 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SGPP1Q9BX95 441 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCBD2Q9H0N5 130 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IRAK4Q9NWZ3 460 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A0J9YVX5 310 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC35E2BP0CK96 405 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MYBL2P10244 700 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCND1P24385 295 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CRABP2P29373 138 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RORAP35398 523 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GMPRP36959 345 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PMS2P54278 862 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CSHL1Q14406 222 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF425Q6IV72 752 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TLDC1Q6P9B6 456 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAQR7Q86WK9 346 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR56A3Q8NH54 315 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATL1Q8WXF7 558 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PAFAH2Q99487 392 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TXLNGYQ9BZA5 131 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCMTD2Q9NV79 361 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CROTQ9UKG9 612 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 INHBAP08476 426 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABHD2P08910 425 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HBQ1P09105 142 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DLSTP36957 453 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP6V0D1P61421 351 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDKL1Q00532 357 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FRMPD2BQ6IN97 320 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms