RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437713.5

TTC28-AS1-216, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 854 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM60AQ9NP50 221 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TXNDC16Q9P2K2 825 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 A0A1W2PPV9 198 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM159BA6NKW6 160 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 E7ENX8 843 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 H3BMH7 237 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MEN1O00255 615 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2B3O76000 313 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC16A8O95907 504 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NTRK1P04629 796 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RAB40ALP0C0E4 278 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SFTPCP11686 197 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TCN2P20062 427 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AGXTP21549 392 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCND1P24385 295 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SSTR1P30872 391 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 STX2P32856 288 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DLSTP36957 453 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRIA3P42263 894 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 BDKRB1P46663 353 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ARSFP54793 590 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CDKN2DP55273 166 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 AP1S2P56377 157 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC7A5Q01650 507 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 POU4F1Q01851 419 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GUCY2DQ02846 1103 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAP2Q03519 686 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DNASE1L3Q13609 305 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CUL1Q13616 776 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZIC1Q15915 447 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRTP1Q5TC63 336 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRIM73Q86UV7 250 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 VASH2Q86V25 355 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SYTL1Q8IYJ3 562 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DSELQ8IZU8 1212 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPATCH11Q8N954 259 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 OR2L3Q8NG85 312 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF480Q8WV37 535 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ATL1Q8WXF7 558 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CLIP3Q96DZ5 547 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CRELD1Q96HD1 420 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PKP4Q99569 1192 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NDNQ99608 321 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MCMBPQ9BTE3 642 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 EURLQ9NYK6 297 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SNX7Q9UNH6 387 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SEC16AO15027 2179 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZZEF1O43149 2961 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TXNDC9O14530 226 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ZNF749O43361 778 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TIAF1O95411 115 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TSPAN12O95859 305 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 MAGP20916 626 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PHBP35232 272 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RORAP35398 523 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GP5P40197 560 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 SLC12A2P55011 1212 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TAS2R39P59534 338 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GPX6P59796 221 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 GRM7Q14831 915 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 TRADDQ15628 312 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 ICE2Q659A1 982 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 FCRL6Q6DN72 434 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 RHBDD2Q6NTF9 364 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.81□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-216ENST00000437713 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms