RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 CCNKO75909 580 aa14.53□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.52□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TAPBPO15533 448 aa14.52□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 DEFA3P59666 94 aa14.52□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.52□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ENTHD1Q8IYW4 607 aa14.52□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.52□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.52□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 AGAP4Q96P64 663 aa14.52□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.52□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 RTP2Q5QGT7 225 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PSKH2Q96QS6 385 aa14.52□□□□□ -0.09
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TOP3B-206ENST00000436282 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GREB1Q4ZG55 1949 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 F5H5T6 163 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 DIRAS1O95057 198 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GUCA1CO95843 209 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SEMG1P04279 462 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TM4SF4P48230 202 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAM189BP81408 668 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SGO1Q5FBB7 561 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 FAHD1Q6P587 224 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 P3H2Q8IVL5 708 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.52□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 INSIG1O15503 277 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SNX4O95219 450 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 APOA1P02647 267 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SLC11A1P49279 550 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 VLDLRP98155 873 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 STK40Q8N2I9 435 aa14.51□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.51□□□□□ -0.09
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