RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433274.6

SF1-209, Transcript of splicing factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF1, Length 2,317 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1-209ENST00000433274 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 TMEM74Q96NL1 305 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 APOOQ9BUR5 198 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 KCNK6Q9Y257 313 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.66□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 KANSL1LA0AUZ9 987 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 SCAMP1O15126 338 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 USP30Q70CQ3 517 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 EBPLQ9BY08 206 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 CLMPQ9H6B4 373 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 NANOGQ9H9S0 305 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 PRPS2P11908 318 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 MAPK1P28482 360 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 ACSL1P33121 698 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 EOGTQ5NDL2 527 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 DHFR2Q86XF0 187 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 EGLN2Q96KS0 407 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 PPM1MQ96MI6 270 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 SUFUQ9UMX1 484 aa14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SF1-209ENST00000433274 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.65□□□□□ -0.06
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SF1-209ENST00000433274 LRATO95237 230 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 RPN2P04844 631 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF1-209ENST00000433274 PGRP06401 933 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CLDN8P56748 225 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CLDN2P57739 230 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CCINQ13939 588 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF1-209ENST00000433274 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 MED27Q6P2C8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ZFP1Q6P2D0 407 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 FLCNQ8NFG4 579 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF1-209ENST00000433274 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SF1-209ENST00000433274 ETHE1O95571 254 aa14.64□□□□□ -0.07
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SF1-209ENST00000433274 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LRGUKQ96M69 825 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 C12orf66Q96MD2 445 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ZNF570Q96NI8 536 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ALG2Q9H553 416 aa14.64□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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