RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 HOXD12P35452 270 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GRK3P35626 688 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PIK3CBP42338 1070 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SCTRP47872 440 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CCR8P51685 355 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ARFIP1P53367 373 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NUBP1P53384 320 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FOXA1P55317 472 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C21orf59P57076 290 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KLF10Q13118 480 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRKG2Q13237 762 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 DOC2AQ14183 400 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KIR2DS3Q14952 304 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AP5B1Q2VPB7 878 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CCSMST1Q4G0I0 132 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 Q6ZSR9 355 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NRROSQ86YC3 692 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LAS2Q8IYD9 372 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MIER2Q8N344 545 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GAB3Q8WWW8 586 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PYCR2Q96C36 320 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL29Q96CT2 875 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PDXPQ96GD0 296 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OR4K3Q96R72 315 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RTKNQ9BST9 563 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RHBGQ9H310 441 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF385DQ9H6B1 395 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CD320Q9NPF0 282 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf109Q9NX04 203 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AHSPQ9NZD4 102 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 EML5Q05BV3 1969 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LRP4O75096 1905 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 A0A0C4DFX4 3053 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 BBIP1A8MTZ0 92 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM233B4DJY2 109 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZW10O43264 779 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MYO1DO94832 1006 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KRT16P08779 473 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 COX4I1P13073 169 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CMPK1P30085 196 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PKLRP30613 574 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC19A1P41440 591 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 RXRGP48443 463 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CORO7P57737 925 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NXPH1P58417 271 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 TBPL1P62380 186 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 COQ5Q5HYK3 327 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL35Q6PF15 583 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ASRGL1Q7L266 308 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 FRMD1Q8N878 549 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 CEP76Q8TAP6 659 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 LCN9Q8WX39 176 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 STARD8Q92502 1023 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 NEIL2Q969S2 332 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-211ENST00000425989 C3orf30Q96M34 536 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms