RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WBP1Q96G27 269 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LMLNQ96KR4 655 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZNF778Q96MU6 729 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OBP2AQ9NY56 170 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 COPG2Q9UBF2 871 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCDC189A1A4V9 331 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C2orf81A6NN90 581 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ENO4A6NNW6 628 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CAPN14A8MX76 684 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TMEM114B3SHH9 223 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SNNO75324 88 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SERPINE1P05121 402 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C2P06681 752 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC35E2BP0CK96 405 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NEFHP12036 1026 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MAKP20794 623 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DRD1P21728 446 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NFKBIAP25963 317 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SERPINA4P29622 427 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HLA-FP30511 346 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ALDH3A1P30838 453 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB5P36952 375 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SUOXP51687 545 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC12A2P55011 1212 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TMPRSS15P98073 1019 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OCRLQ01968 901 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ASPHQ12797 758 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IHHQ14623 411 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PCLAFQ15004 111 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CHI3L2Q15782 390 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 KLC3Q6P597 504 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LINGO4Q6UY18 593 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RAPH1Q70E73 1250 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OTOAQ7RTW8 1153 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DENND6AQ8IWF6 608 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 STK40Q8N2I9 435 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCDC63Q8NA47 563 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C10orf82Q8WW14 230 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 STON2Q8WXE9 905 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LYSMD1Q96S90 227 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BBS2Q9BXC9 721 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SPHK2Q9NRA0 654 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TLK1Q9UKI8 766 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 EMCNQ9ULC0 261 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCL26Q9Y258 94 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZNF711Q9Y462 761 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NF1P21359 2839 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FBN3Q75N90 2809 aa6.43□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 A0A0J9YYE9 177 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCDC78A2IDD5 438 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.42□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms