RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 STK16O75716 305 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RENP00797 406 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TAF13Q15543 124 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FGD3Q5JSP0 725 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 AWAT2Q6E213 333 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 JAZF1Q86VZ6 243 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A7Q99884 636 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SEC14L3Q9UDX4 400 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PAPPAQ13219 1627 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC12A8A0AV02 714 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RYKP34925 604 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DLSTP36957 453 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PTGIRP43119 386 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PDX1P52945 283 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CRISP3P54108 245 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC9A5Q14940 896 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LIPJQ5W064 366 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TCEAL6Q6IPX3 200 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SATL1Q86VE3 508 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CARM1Q86X55 608 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR10A6Q8NH74 314 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PFDN5Q99471 154 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 A0A096LPI6 279 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LCHNA4D1U4 455 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A9O60656 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PSMD10O75832 226 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 INHAP05111 366 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A6P19224 532 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A4P22310 534 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CLCN4P51793 760 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GPR143P51810 404 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MTAPQ13126 283 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R3AQ16821 1122 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PXYLP1Q8TE99 480 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SNAPC3Q92966 411 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CMTM3Q96MX0 182 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF382Q96SR6 550 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A7Q9HAW7 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A10Q9HAW8 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 UGT1A8Q9HAW9 530 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEB17A8MXT2 336 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RASGRP1O95267 797 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CSN2P05814 226 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF286BP0CG31 522 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NR2F1P10589 423 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEA6P43360 314 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFV1P49821 464 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NFKB2Q00653 900 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LY6KQ17RY6 165 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CDNFQ49AH0 187 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KIAA1211LQ6NV74 962 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ACDQ96AP0 544 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 AGRPO00253 132 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RNF13O43567 381 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RGS11O94810 467 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CBX6O95503 412 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms