RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPT1CQ8TCG5 803 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ASB15Q8WXK1 588 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PTERQ96BW5 349 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPER2Q96P56 530 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM111AQ96PZ2 611 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MCMBPQ9BTE3 642 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IL37Q9NZH6 218 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TLCD2A6NGC4 264 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 VSTM5A8MXK1 200 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CDC7O00311 574 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SAP18O00422 153 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DIAPH2O60879 1101 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AP2A2O94973 939 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TCF3P15923 654 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN8P19075 237 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 LSP1P33241 339 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GDF10P55107 478 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1024LP59773 190 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 COPZ1P61923 177 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DSG2Q14126 1118 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MORF4L2Q15014 288 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TLR1Q15399 786 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SCIMPQ6UWF3 145 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 IQCKQ8N0W5 287 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SIRT6Q8N6T7 355 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DNASE2BQ8WZ79 361 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BMFQ96LC9 184 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD9Q96Q07 612 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MGME1Q9BQP7 344 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZPBPQ9BS86 351 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 VPS18Q9P253 973 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YY10 115 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MEN1O00255 615 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TP53I11O14683 189 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF749O43361 778 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GJB3O75712 270 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 METTL18O95568 372 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 C8GP07360 202 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OCM2P0CE71 109 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EBLN1P0CF75 366 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ICAM2P13598 275 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CCNA2P20248 432 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CRABP2P29373 138 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A1P30825 629 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINB8P50452 374 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MPP1Q00013 466 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SRYQ05066 204 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SEMA5AQ13591 1074 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RAB21Q9UL25 225 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MYO7BQ6PIF6 2116 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 D6RAR5 112 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NPIPA5E9PKD4 350 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ULK1O75385 1050 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR6A2O95222 327 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EFEMP2O95967 443 aa4.29□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TGFB1P01137 390 aa4.29□□□□□ -1.72
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