RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.29■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ITPR2Q14571 2701 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 FITM1A5D6W6 292 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 E5RI56 91 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 CHRM3P20309 590 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 FMO4P31512 558 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 GCGRP47871 477 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 CCNG2Q16589 344 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 COX15Q7KZN9 410 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ACAT2Q9BWD1 397 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 P2RY12Q9H244 342 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.28■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF839A8K0R7 811 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 CTSVO60911 334 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 VAPBO95292 243 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 PAMP19021 973 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 NMBRP28336 390 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 SARNPP82979 210 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM151BQ8IW70 566 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 HMGCLL1Q8TB92 370 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 TREX1Q9NSU2 369 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 C3orf18Q9UK00 162 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa22.27■■□□□ 1.16
TMEM54-201ENST00000329151 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 PHF2O75151 1096 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CCNDBP1O95273 360 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 HPP00738 406 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 MGAT1P26572 445 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ARG2P78540 354 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 KLC1Q07866 573 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CASC4Q6P4E1 433 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 GRHL3Q8TE85 626 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 FAM136AQ96C01 138 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 TCF12Q99081 682 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 DPH7Q9BTV6 452 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.26■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 DYTNA2CJ06 578 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 USP1O94782 785 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ESR1P03372 595 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CATP04040 527 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ANXA5P08758 320 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 COL8A1P27658 744 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CCSMST1Q4G0I0 132 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF787Q6DD87 383 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 RNF44Q7L0R7 432 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 SMPDL3AQ92484 453 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 SAMD15Q9P1V8 674 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.25■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 WIPF3A6NGB9 483 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 NIPSNAP2O75323 286 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 EDN3P14138 238 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 ATP5DP30049 168 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CDK16Q00536 496 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 MFAP5Q13361 173 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CRB2Q5IJ48 1285 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 IGFL2Q6UWQ7 119 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 KCNMB4Q86W47 210 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 LMF1Q96S06 567 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 SYBUQ9NX95 663 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.24■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 KRT87PA6NCN2 255 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 CLDN1O95832 211 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 PKMP14618 531 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 FDXRP22570 491 aa22.23■■□□□ 1.15
TMEM54-201ENST00000329151 HSD17B2P37059 387 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms