RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312295.4

RTP1-201, Transcript of receptor transporter protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RTP1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1-201ENST00000312295 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ZNF740Q8NDX6 193 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 APOLD1Q96LR9 279 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 OR2M4Q96R27 311 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GPR89AB7ZAQ6 455 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 STK25O00506 426 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RASGRP1O95267 797 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ETHE1O95571 254 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GPR89BP0CG08 455 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CDH1P12830 882 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PSME3P61289 254 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CEACAM7Q14002 265 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SYT13Q7L8C5 426 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 OR13H1Q8NG92 308 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 BIRC7Q96CA5 298 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 C1orf109Q9NX04 203 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.64□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CCDC154A6NI56 674 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 LRATO95237 230 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KELP23276 732 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TACR1P25103 407 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MTTPP55157 894 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KRT33BQ14525 404 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 RCN1Q15293 331 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 LIPJQ5W064 366 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 GPR156Q8NFN8 814 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MIEF2Q96C03 454 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TSSK3Q96PN8 268 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SGPP1Q9BX95 441 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MAP10Q9P2G4 905 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 POMPQ9Y244 141 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.63□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 AKT2P31751 481 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SOX11P35716 441 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FZD5Q13467 585 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 Q6ZSR6 202 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 HID1Q8IV36 788 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC5A11Q8WWX8 675 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 WDR92Q96MX6 357 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MENTQ9BUN1 341 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 MRGBPQ9NV56 204 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 ANKRD28O15084 1053 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 B3GALT4O96024 378 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 BCKDHAP12694 445 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CCR3P51677 355 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SLC7A2P52569 658 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 KIAA1024LP59773 190 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CTBSQ01459 385 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DMPKQ09013 629 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 CCDC6Q16204 474 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 OR7G3Q8NG95 312 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 STMN2Q93045 179 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 EGLN2Q96KS0 407 aa14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTP1-201ENST00000312295 FRYLO94915 3013 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms