RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 PHF24Q9UPV7 400 aa13.48□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 A0A0D9SEW6 157 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GJA5P36382 358 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RPS9P46781 194 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RPS14P62263 151 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SMCO1Q147U7 214 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ZNF805Q5CZA5 627 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PLA2G15Q8NCC3 412 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 MAPK15Q8TD08 544 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CLEC4AQ9UMR7 237 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 A0A0G2JPF8 293 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 FAM149AA5PLN7 773 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 C9JVG2 144 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ZNF806P0C7X5 589 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NRLP54845 237 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RING1Q06587 406 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PCDH1Q08174 1060 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 LMAN2Q12907 356 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GPRC6AQ5T6X5 926 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 P4HA3Q7Z4N8 544 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GJD3Q8N144 294 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 KAT2AQ92830 837 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PREPP48147 710 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 STK19P49842 368 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RAB33AQ14088 237 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 LCN1P1Q5VSP4 162 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GLYATQ6IB77 296 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TRPV3Q8NET8 790 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RGMAQ96B86 450 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 DHRS7Q9Y394 339 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PEX16Q9Y5Y5 336 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 WASF2Q9Y6W5 498 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 C2orf78A6NCI8 922 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 IGFBP5P24593 272 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NTSR1P30989 418 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 KCNJ5P48544 419 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 AQP4P55087 323 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RAB15P59190 212 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 WDR92Q96MX6 357 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 OR2M4Q96R27 311 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NODALQ96S42 347 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 LRRC37A3O60309 1634 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 A0A1W2PQU0 124 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CDC7O00311 574 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PIP5K1BO14986 540 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TP73O15350 636 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 AIREO43918 545 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 AHCYP23526 432 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PDX1P52945 283 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 NTHL1P78549 312 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.47□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 ELOVL7A1L3X0 281 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 MAGEB17A8MXT2 336 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 B4GALT2O60909 372 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TMEM63AO94886 807 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 BDKRB1P46663 353 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RBBP4Q09028 425 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 C1orf61Q13536 156 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 FBXO43Q4G163 708 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 OGFOD2Q6N063 350 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 AHSA2Q719I0 299 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 FOXJ1Q92949 421 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 LRIG1Q96JA1 1093 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PRKD3O94806 890 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GALNT2Q10471 571 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 COLEC12Q5KU26 742 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CPNE8Q86YQ8 564 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 GPR65Q8IYL9 337 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 PGAM4Q8N0Y7 254 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 MR1Q95460 341 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 USP29Q9HBJ7 922 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.46□□□□□ -0.25
USP22-201ENST00000261497 CAPN14A8MX76 684 aa13.46□□□□□ -0.26
USP22-201ENST00000261497 DCLK1O15075 740 aa13.46□□□□□ -0.26
USP22-201ENST00000261497 GRK6P43250 576 aa13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms