RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 ANKRD46Q86W74 232 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C2orf69Q8N8R5 385 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF596Q8TC21 504 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KAT5Q92993 513 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GJA10Q969M2 543 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MTFR1LQ9H019 292 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 J3QR89 54 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MEIS1O00470 390 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C7P10643 843 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GNSP15586 552 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C5AR1P21730 350 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RAD52P43351 418 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PTTG1IPP53801 180 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C2orf80Q0P641 193 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CDH18Q13634 790 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PDK2Q15119 407 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NRROSQ86YC3 692 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DAW1Q8N136 415 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GMCL1Q96IK5 515 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ITPAQ9BY32 194 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RIPK3Q9Y572 518 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DLG5Q8TDM6 1919 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR7A17O14581 309 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MED6O75586 246 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 C1QBP02746 253 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ERBB2P04626 1255 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 BMP1P13497 986 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NCK1P16333 377 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CTBP2P56545 445 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KLF10Q13118 480 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SNAPC2Q13487 334 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CEP68Q76N32 757 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ACDQ96AP0 544 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 MED8Q96G25 268 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ARL6Q9H0F7 186 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RNF146Q9NTX7 359 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.6□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR5K3A6NET4 321 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PRAMEF2O60811 474 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 AKAP3O75969 853 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 DIRAS3O95661 229 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ELFN1P0C7U0 828 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GM2AP17900 193 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ALDH3B1P43353 468 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LIMK2P53671 638 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CRADDP78560 199 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FOXO1Q12778 655 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OIT3Q8WWZ8 545 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ARL11Q969Q4 196 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 OR14A2Q96R54 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 NUDT15Q9NV35 164 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LNP1A1A4G5 178 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 BANF1O75531 89 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 SCGB1D2O95969 90 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 GPIP06744 558 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 ACSM4P0C7M7 580 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CBSLP0DN79 551 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 PCSK2P16519 638 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FPR3P25089 353 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 LAP3P28838 519 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 BDKRB2P30411 391 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 CBSP35520 551 aa6.59□□□□□ -1.35
PDGFRA-201ENST00000257290 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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