RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046207.8

Sf3b6-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b6, Length 1,180 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gprin3Q8BWS5 763 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cars2Q8BYM8 551 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Zbtb20Q8K0L9 741 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr315Q8VFG7 309 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Mrgpra2Q91WW4 305 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Nek8Q91ZR4 698 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sec14l2Q99J08 403 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cisd2Q9CQB5 135 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Neu2Q9JMH3 379 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tmem115Q9WUH1 350 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ptdss2Q9Z1X2 473 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 H2afb2S4R1M3 115 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Akap6E9Q9K8 2307 aa14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 OtoglF7A4A7 2325 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ighv1-43A0A0A6YXN5 117 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm12666A2AMD0 254 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 HgdO09173 445 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Dhcr7O88455 471 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Zfp26P10076 861 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 PpargP37238 505 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pon1P52430 355 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rasgrf2P70392 1189 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Adra1bP97717 514 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 G6pdxQ00612 515 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ptpn2Q06180 406 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Q149G0 166 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Defb33Q30KN3 62 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Q3U4G0 281 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rnf44Q3UHJ8 407 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fam83fQ3UKU4 495 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Trim75Q3UWZ0 467 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rcsd1Q3UZA1 412 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pik3r3Q64143 461 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tsga10Q6NY15 697 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sra1Q80VJ2 232 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Abhd16bQ80YU0 474 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Zfand1Q8BFR6 268 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Timmdc1Q8BUY5 285 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Amdhd2Q8JZV7 409 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ntng1Q8R4G0 539 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Chrdl2Q8VEA6 426 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr811Q8VFI1 319 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Smap1Q91VZ6 440 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Q91W34 466 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 CenpqQ9CPQ5 267 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Adck1Q9D0L4 525 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ddx59Q9DBN9 619 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Aff4Q9ESC8 1160 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fgf21Q9JJN1 210 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slc25a13Q9QXX4 676 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Nxt1Q9QZV9 140 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cdh22Q9WTP5 813 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Mbd1Q9Z2E2 636 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fem1aaQ9Z2G1 654 aa14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Mcf2A2AEU1 1111 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gabrr3B2RXA8 464 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vmn2r99H3BK37 856 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Il1aP01582 270 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ica1P97411 478 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pitpnm3Q3UHE1 974 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slfn4Q3UV66 602 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Q5SPV6 233 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Grm7Q68ED2 915 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Msrb2Q78J03 175 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ip6k2Q80V72 448 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 PeloQ80X73 385 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pex26Q8BGI5 305 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Msantd1Q8BIL2 278 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tmbim1Q8BJZ3 309 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fam214bQ8BR27 538 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gpat3Q8C0N2 438 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tmem154Q8C4Q9 181 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 C130026I21RikQ8C898 291 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Il17rdQ8JZL1 738 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ccm2Q8K2Y9 453 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 St8sia6Q8K4T1 398 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr584Q8VGW0 319 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Clec2fQ8VI21 196 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Eci2Q9WUR2 391 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cst9Q9Z0H6 137 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 G6pc2Q9Z186 355 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 MpdzQ8VBX6 2055 aa14.7□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tenm4Q3UHK6 2771 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Lrrc74aA0A1Y7VMD6 494 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr1179A2AUS6 307 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr1056A2AVY0 313 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm3752A6NAT4 150 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cfap221A9Q751 836 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vmn2r7E9PYL5 915 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Lrrc31F6VYM1 502 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm10340K7N708 205 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr741L7N1Y5 311 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Dnmt3bO88509 859 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 P01675 107 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 P01676 107 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 P01677 107 aa14.69□□□□□ -0.06
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 P01678 107 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms