RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	NCSTN	Q92542	709 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	RTP4	Q96DX8	246 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	WDR24	Q96S15	920 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	NUP85	Q9BW27	656 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CREBBP	Q92793	2442 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A0J9YYE9	177 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PSMD11	O00231	422 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PPFIA2	O75334	1257 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TRBC1	P01850	177 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PIRT	P0C851	137 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TYRP1	P17643	537 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	F8A1	P23610	371 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CD82	P27701	267 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TEAD1	P28347	426 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PRKCI	P41743	596 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	GFER	P55789	205 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TAS2R40	P59535	323 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	HHEX	Q03014	270 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	GALNT2	Q10471	571 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	DPYSL3	Q14195	570 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	GALNT3	Q14435	633 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	BOLA3	Q53S33	107 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ALS2CL	Q60I27	953 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM135	Q86UB9	458 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	BBS5	Q8N3I7	341 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TEX26	Q8N6G2	289 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	OR10G6	Q8NH81	332 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	EID2B	Q96D98	161 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	COX14	Q96I36	57 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	DDA1	Q9BW61	102 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ISCU	Q9H1K1	167 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	MYO6	Q9UM54	1294 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A087X0T9	212 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		A0A1W2PQ67	120 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		A6NCN8	305 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		B4E171	279 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM227A	F5H4B4	570 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		H3BUI4	141 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658		K7EM74	188 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	KCNK1	O00180	336 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	MTX2	O75431	263 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	STK17B	O94768	372 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	MMP2	P08253	660 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM228B	P0C875	321 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	MAL	P21145	153 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TSPAN7	P41732	249 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CD86	P42081	329 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CCR10	P46092	362 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	FASLG	P48023	281 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ARSE	P51690	589 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CTXN1	P60606	82 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	MC2R	Q01718	297 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CDC20	Q12834	499 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	DUSP8	Q13202	625 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	IYD	Q6PHW0	289 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	PQLC3	Q8N755	202 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.54
MFSD8-240	ENST00000641658	EXD1	Q8NHP7	514 aa		5.4	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms