RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SYTL1Q8IYJ3 562 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 OR2L3Q8NG85 312 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 LRRC1Q9BTT6 524 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ACTL8Q9H568 366 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 EURLQ9NYK6 297 aa21.51■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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SYT6-210ENST00000641643 CTAGE8P0CG41 777 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PTPN4P29074 926 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CMPK1P30085 196 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 GRIA3P42263 894 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PNLIPRP1P54315 467 aa21.5■■□□□ 1.03
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SYT6-210ENST00000641643 DEFB109BQ30KR1 87 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 MYO1HQ8N1T3 1032 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ACAT2Q9BWD1 397 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 VWA7Q9Y334 891 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PPV9 198 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 GFYI3L273 518 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ERGP11308 486 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CDKN2DP55273 166 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CAV1Q03135 178 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 FCRL6Q6DN72 434 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 FAM45BPQ6NSW5 357 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 C8orf74Q6P047 294 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PAQR3Q6TCH7 311 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CAPN12Q6ZSI9 719 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SPNS2Q8IVW8 549 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 OR2A1Q8NGT9 310 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 FAM45AQ8TCE6 357 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 MCOLN3Q8TDD5 553 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 NDC1Q9BTX1 674 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 FAM117AQ9C073 453 aa21.49■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 C9J4A7 227 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYT6-210ENST00000641643 SLC7A5Q01650 507 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PTCHD3Q3KNS1 767 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SYVN1Q86TM6 617 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 C17orf62Q9BQA9 187 aa21.48■■□□□ 1.03
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SYT6-210ENST00000641643 MOCS1Q9NZB8 636 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SNX7Q9UNH6 387 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 POLHQ9Y253 713 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SPTA1P02549 2419 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 COL6A6A6NMZ7 2263 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CDC14CA4D256 554 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CCNDBP1O95273 360 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 C8GP07360 202 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 RAB40ALP0C0E4 278 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 IL2P60568 153 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
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SYT6-210ENST00000641643 TRADDQ15628 312 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 STRA8Q7Z7C7 330 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CEP112Q8N8E3 955 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 EXD3Q8N9H8 876 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PROKR1Q8TCW9 393 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ZNF480Q8WV37 535 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 CDKL2Q92772 493 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 DLG3Q92796 817 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 LINGO1Q96FE5 620 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 RUFY1Q96T51 708 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 NLNQ9BYT8 704 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 ABCF3Q9NUQ8 709 aa21.48■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 E7ENX8 843 aa21.47■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 H3BMH7 237 aa21.47■■□□□ 1.03
SYT6-210ENST00000641643 POLE2P56282 527 aa21.47■■□□□ 1.03
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