RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 DNASE1P24855 282 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 G0S2P27469 103 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC7A1P30825 629 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 FMO4P31512 558 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 CCR7P32248 378 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 MCAMP43121 646 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 DNA2P51530 1060 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 NRLP54845 237 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNK10P57789 538 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 ACTR1AP61163 376 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 PSME3P61289 254 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 GK3PQ14409 553 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF404Q494X3 552 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC36A3Q495N2 470 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 Q5BKY6 102 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 LIPJQ5W064 366 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 PAGE2Q7Z2X7 111 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM17Q86X19 198 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 IL17REQ8NFR9 667 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 CEP76Q8TAP6 659 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 P2RX5Q93086 422 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 Q96MT0 163 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 MYL10Q9BUA6 226 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 ADI1Q9BV57 179 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 STRA6Q9BX79 667 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
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SAMMSON-210ENST00000641260 IL26Q9NPH9 171 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 NANSQ9NR45 359 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 COL20A1Q9P218 1284 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 A0A1W2PN81 502 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 C7orf72A4D263 438 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.04□□□□□ -1.44
SAMMSON-210ENST00000641260 ARHGEF33A8MVX0 844 aa6.04□□□□□ -1.44
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