RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SPTBP11277 2137 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC5A10A0PJK1 596 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD33BA6NCL7 494 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MKRN2OSH3BPM6 223 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KCNJ13O60928 360 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SPAG6O75602 509 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TSPAN12O95859 305 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 C9P02748 559 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MT-ND3P03897 115 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SHBGP04278 402 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 POLBP06746 335 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC35G4P0C7Q5 338 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RALBP11234 206 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF28P17035 718 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 OAS2P29728 719 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FMO4P31512 558 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 STAT5AP42229 794 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CAPZBP47756 277 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CLCN7P51798 805 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PPP1CAP62136 330 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PRAMEP78395 509 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ACY1Q03154 408 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DMPKQ09013 629 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PRKAA1Q13131 559 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CALCOCO2Q13137 446 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TUBB3Q13509 450 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CUL1Q13616 776 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MAP7Q14244 749 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 COLEC12Q5KU26 742 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 WASH2PQ6VEQ5 465 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 OOSP2Q86WS3 158 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CEP97Q8IW35 865 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TEX19Q8NA77 164 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CD200R1Q8TD46 325 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FBF1Q8TES7 1133 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 UBXN4Q92575 508 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DLG3Q92796 817 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ULK4Q96C45 1275 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC39Q96DD0 335 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FMO2Q99518 471 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MAP3K3Q99759 626 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MENTQ9BUN1 341 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 COG4Q9H9E3 785 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SOHLH2Q9NX45 425 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 EURLQ9NYK6 297 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SAMD15Q9P1V8 674 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CIDEBQ9UHD4 219 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TUBD1Q9UJT1 453 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RAB21Q9UL25 225 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PADI1Q9ULC6 663 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 POLHQ9Y253 713 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 NFS1Q9Y697 457 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MAGEB16A2A368 324 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GSAPA4D1B5 854 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 OR6C74A6NCV1 312 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MGAT4DA6NG13 374 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 H3BMM5 538 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RIPK2O43353 540 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GPC4O75487 556 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RFPL1O75677 317 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ACSL3O95573 720 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DLGAP3O95886 979 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 NTRK1P04629 796 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 EBLN1P0CF75 366 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms