RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620099.1

SNORD39.4-201, humanhuman

BASIC

Gene SNORD39, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM90A14PP0C7W9 464 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCNB1P14635 433 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DRD1P21728 446 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GABRR2P28476 465 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR1E1P30953 314 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 AKT1P31749 480 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CA8P35219 290 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HSD17B3P37058 310 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 AVPR1AP37288 418 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KCNJ1P48048 391 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LMAN1P49257 510 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SERPINB9P50453 376 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CLCN2P51788 898 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PDE1BQ01064 536 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 E2F1Q01094 437 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GBE1Q04446 702 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SULT2A1Q06520 285 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC20A2Q08357 652 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 AP1B1Q10567 949 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDH17Q12864 832 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPM6BQ13491 265 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDH18Q13634 790 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CBFBQ13951 182 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DMC1Q14565 340 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CA9Q16790 459 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MPPE1Q53F39 396 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TEX44Q53QW1 395 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LGSNQ5TDP6 509 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MARC1Q5VT66 337 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ACSM6Q6P461 480 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LRRC8BQ6P9F7 803 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NLRP9Q7RTR0 991 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCDC91Q7Z6B0 441 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LCA5Q86VQ0 697 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NLRP14Q86W24 1093 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMC8Q8IU68 726 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 P3H2Q8IVL5 708 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LMNTD2Q8IXW0 634 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF683Q8IZ20 524 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IQCKQ8N0W5 287 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CCNYQ8ND76 341 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 OR1N1Q8NGS0 311 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 PYROXD1Q8WU10 500 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 HMGB4Q8WW32 186 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDKL2Q92772 493 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 C3orf49Q96BT1 292 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MTBPQ96DY7 904 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 P2RY11Q96G91 374 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAR2Q96K12 515 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 B3GALT6Q96L58 329 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FCRL5Q96RD9 977 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CYTH2Q99418 400 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL12RB2Q99665 862 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SLC2A11Q9BYW1 496 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IL22Q9GZX6 179 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TASP1Q9H6P5 420 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NOD2Q9HC29 1040 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FSCN3Q9NQT6 498 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 OSER1Q9NX31 292 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 COX16Q9P0S2 106 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF69Q9UC07 566 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 RSPH14Q9UHP6 348 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 DAPP1Q9UN19 280 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 NCOR1O75376 2440 aa3.4□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 TMEM131Q92545 1883 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.39□□□□□ -1.87
SNORD39.4-201ENST00000620099 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms