RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 DIAPH2O60879 1101 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 WISP2O76076 250 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 WDPCPO95876 746 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 S1PR4O95977 384 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 APOC2P02655 101 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CELA2AP08217 269 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 OR56A5P0C7T3 313 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 TPH1P17752 444 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CAPN3P20807 821 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FDXRP22570 491 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 KIR3DL1P43629 444 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ITIH4Q14624 930 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CDSNQ15517 529 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CNSTQ6PJW8 725 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CHP1Q99653 195 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 IFNKQ9P0W0 207 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ALG6Q9Y672 507 aa14.57□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 HCFC1P51610 2035 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 OR51F1A6NGY5 319 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SLC19A2O60779 497 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CTSVO60911 334 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 BMP10O95393 424 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CLDN14O95500 239 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SERPINA7P05543 415 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 AGAP20933 346 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CXCR2P25025 360 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MARCKSL1P49006 195 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SMSP52788 366 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 PMP22Q01453 160 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 C3AR1Q16581 482 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CCDC181Q5TID7 509 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 PACS1Q6VY07 963 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 BBS12Q6ZW61 710 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CDH24Q86UP0 819 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 VRK3Q8IV63 474 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CEP97Q8IW35 865 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 AMER2Q8N7J2 671 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 STYXQ8WUJ0 223 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 LRRC45Q96CN5 670 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 TINAGQ9UJW2 476 aa14.56□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 A0A0J9YVX5 310 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 IDSB3KWA1 339 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 TARM1B6A8C7 271 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ITGAMP11215 1152 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 EMP2P54851 167 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 GRB7Q14451 532 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 POU6F1Q14863 301 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ACTL9Q8TC94 416 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 C14orf79Q96F83 325 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CCDC42Q96M95 316 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 DNAJC7Q99615 494 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FAM118BQ9BPY3 351 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.55□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 OR5H15A6NDH6 313 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 RASGRF2O14827 1237 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 FFAR3O14843 346 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 GPR42O15529 346 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 OR1I1O60431 355 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 PRAMEF2O60811 474 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 RPN2P04844 631 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 MYBL2P10244 700 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 RBP3P10745 1247 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 CCR7P32248 378 aa14.54□□□□□ -0.08
IFT20-216ENST00000588477 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms