RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	NMBR	P28336	390 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	FMO4	P31512	558 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	UQCRFS1	P47985	274 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	C4orf17	Q53FE4	359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	OR2L3	Q8NG85	312 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MIPEP	Q99797	713 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	HYKK	A2RU49	373 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	FITM1	A5D6W6	292 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	TXNDC9	O14530	226 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	UMOD	P07911	640 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	BDKRB1	P46663	353 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	GLRB	P48167	497 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	GRB7	Q14451	532 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	NKG7	Q16617	165 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MFSD3	Q96ES6	412 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	NFS1	Q9Y697	457 aa		13.13	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743		A0A0J9YVX5	310 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PCDH17	O14917	1159 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	UQCRH	P07919	91 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CXCR2	P25025	360 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	KCNJ1	P48048	391 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	EMP3	P54852	163 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	GPS1	Q13098	491 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743		Q8NA96	180 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CALML6	Q8TD86	181 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	LPGAT1	Q92604	370 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	BIRC8	Q96P09	236 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CRB3	Q9BUF7	120 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	LHPP	Q9H008	270 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MAP2K7	O14733	419 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	NIPSNAP2	O75323	286 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	USP1	O94782	785 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MATN4	O95460	622 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	KRT14	P02533	472 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	CTSB	P07858	339 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ANXA5	P08758	320 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	MLN	P12872	115 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	ACPP	P15309	386 aa		13.11	□□□□□ -0.31
GGA3-208	ENST00000579743	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31

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