RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HEXBP07686 556 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GSTM1P09488 218 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNNT1P13805 278 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PKLRP30613 574 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GSTM4Q03013 218 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 STX1AQ16623 288 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SYTL3Q4VX76 610 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 KAZNQ674X7 775 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 VSIG1Q86XK7 387 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC22A18Q96BI1 424 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF559Q9BR84 538 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TEKT2Q9UIF3 430 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRSS21Q9Y6M0 314 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 E9PLN8 166 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ASNA1O43681 348 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTSVO60911 334 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLCO2B1O94956 709 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 AP2A2O94973 939 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 H2AFZP0C0S5 128 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ICAM2P13598 275 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD9P21926 228 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GEMP55040 296 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HSF1Q00613 529 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RANBP10Q6VN20 620 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 H2AFVQ71UI9 128 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMTC1Q8IUR5 882 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 IL17FQ96PD4 163 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 VAT1Q99536 393 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FOXC2Q99958 501 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 VKORC1Q9BQB6 163 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PACSIN1Q9BY11 444 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HES7Q9BYE0 225 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 VPS13CQ709C8 3753 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A0J9YVX5 310 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRRG2O14669 202 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADAM10O14672 748 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CST8O60676 142 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ANXA9O76027 345 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TSPAN12O95859 305 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 AP2B1P63010 937 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PCOLCEQ15113 449 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DBN1Q16643 649 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4N4Q8N0Y3 316 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CFAP61Q8NHU2 1237 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HAUS1Q96CS2 278 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DMRTA2Q96SC8 542 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.46■□□□□ 0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CACNA1CQ13936 2221 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A1W2PQ72 361 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 S1PR4O95977 384 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 FTH1P02794 183 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADRA1AP35348 466 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 TFDP2Q14188 446 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CES4AQ5XG92 561 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 BEST3Q8N1M1 668 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 GHDCQ8N2G8 530 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 P3H4Q92791 437 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.45■□□□□ 0.06
CTDNEP1-211ENST00000575783 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms