RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 PANX3Q96QZ0 392 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CRB3Q9BUF7 120 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CACNA1DQ01668 2161 aa20.32■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FITM1A5D6W6 292 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF5AQ12840 1032 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SEMA3AQ14563 771 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PEX13Q92968 403 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MIEF2Q96C03 454 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FOPNLQ96NB1 174 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF285Q96NJ3 590 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ENAMQ9NRM1 1142 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CATSPERZQ9NTU4 200 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF148Q9UQR1 794 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa20.31■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FTCDO95954 541 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 HPP00738 406 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ACPPP15309 386 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIA1P42261 906 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MFAP5Q13361 173 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.3■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CREBBPQ92793 2442 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A0J9YVX5 310 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A1B0GUH1 482 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP2K7O14733 419 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CTSVO60911 334 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 NDUFS3O75489 264 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ERVK-10P10266 1014 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CCNFP41002 786 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ARG2P78540 354 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 KLC1Q07866 573 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 C1QL3Q5VWW1 255 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 BCORP1Q8N888 145 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MIPEPQ99797 713 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 OLAHQ9NV23 265 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CENPEQ02224 2701 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ITPR2Q14571 2701 aa20.29■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 DYTNA2CJ06 578 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 LIASO43766 372 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 KLHL18O94889 574 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 C1orf105O95561 183 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 APRTP07741 180 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 Q0VFX4 171 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 NAA25Q14CX7 972 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MUM1Q2TAK8 710 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PCID2Q5JVF3 399 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRC6Q86X45 466 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC89Q8N998 374 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 OR2L3Q8NG85 312 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 C3orf18Q9UK00 162 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CELSR2Q9HCU4 2923 aa20.28■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 E2F3O00716 465 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 USP1O94782 785 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CXCR2P25025 360 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 PSMB5P28074 263 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 DTWD1Q8N5C7 304 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.27■□□□□ 0.84
SLC12A4-208ENST00000572010 HES6Q96HZ4 224 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms